Andres,
La forma más sencilla de crearlos es uno por uno haciendo lo siguiente, abrir una terminal y cambiar al directorio donde se quiere crear los enlaces, en este caso el escritorio, y ejecutar el comando ln -s seguido por la ruta del directorio que se quiere enlazar. Si quiere que el enlace tenga el mismo nombre del directorio original lo deja así nada más, si quiere nombrarlo de otra manera escribe el nombre después de la ruta del directorio original.
Ej.
ln -s /home/pepito/tesis2005
Esto creará un enlace llamado tesis2005
ln -s /home/pepito/tesis2005 trabajo
Esto creará un enlace llamado trabajo, que al abrirlo nos dirije al directorio tesis2005
Espero le haya sido de ayuda.
